Das beobachtete Verhalten stimmt mit folgender Modellvorstellung überein:

• Der Atomkern enthält fast die gesamte Masse des Atoms und ist positiv geladen.
  (Die Teilchen, welche die positiven Ladungen tragen, heissen Protonen.)
• Der Atomkern ist im Verhältnis zum Gesamtatom sehr klein.

Der Bau eines Atoms konnte also zu dieser Zeit wie folgt beschrieben werden:

Rutherford und seine Mitarbeiter schätzten das Verhältnis der Durchmesser von Atom zu Atomkern auf 100.000 : 1.

In der Zeit nach der Entwicklung des Rutherfordschen Modells bestimmte man die Massen der Elementarteilchen etwa wie folgt:
Proton (p) und Neutron (n) haben eine Masse von etwa 1,67 x 10^-24 g,
das Elektron (e) eine Masse von
0,9 x 10^-27 g (=0,000000000000000000000000009 g)

Da die Zahlen sehr unhandlich sind, definierte man die Atommasseneinheit u:
1 u =ca. 1,67 x 10^-24 g

Damit ist m(p)=1 u, m(n)=1 u, m(e)= ca.1/2000 u

Weiter bedeuten diese Zahlen, dass 1g Wasserstoff 6,022 x 10²³ Atome enthält (ebenso 12g Kohlenstoff oder 126,9g Iod).
Allgemein:
Die relative Atommasse eines Elements in Gramm enthält 6,022 x 10²³ Atome.